More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0706 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  326  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  71.25 
 
 
159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  66.25 
 
 
159 aa  221  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  57.32 
 
 
160 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  50.97 
 
 
162 aa  176  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
159 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  51.77 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  51.3 
 
 
178 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
162 aa  153  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
162 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
162 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  51.02 
 
 
160 aa  150  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 
160 aa  149  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
165 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  49.04 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
160 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
165 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 
165 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
168 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
168 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
168 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 
165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 
165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
168 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
164 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
162 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
164 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
163 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
163 aa  130  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
163 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
162 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
163 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
161 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
162 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
162 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  25.71 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  27.7 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  29.71 
 
 
229 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  28.26 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  28.26 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  28.26 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  28.26 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
202 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  26.62 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  28.26 
 
 
229 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  28.78 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  25.32 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>