More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1320 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 162 aa  321  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  62.18 
 
 		 162 aa  203  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  58.75 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  57.32 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  57.41 
 
 		 162 aa  190  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  61.88 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  41.36 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  33.75 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  34.39 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  25.5 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  23.4 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  24.83 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  27.08 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  24.83 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>