More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3464 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  333  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  70.99 
 
 
163 aa  240  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  56.96 
 
 
159 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
163 aa  175  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  47.85 
 
 
163 aa  173  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
159 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
163 aa  157  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 
160 aa  156  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
167 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
160 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  46.91 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
160 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
163 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 
162 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
159 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  46.25 
 
 
162 aa  151  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  45.4 
 
 
178 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
159 aa  140  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
161 aa  140  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  44.17 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 
166 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 
162 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  42.24 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
160 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
160 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  42.24 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  42.24 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
160 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  41.51 
 
 
164 aa  132  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 
165 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
165 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
168 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
168 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
168 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  40.99 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 
161 aa  124  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 
162 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
162 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  27.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  27.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  26.67 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  29.94 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.17 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>