More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0002 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  333  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  65.64 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  64.42 
 
 		 163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  60.12 
 
 		 163 aa  214  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  43.4 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  46.3 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.88 
 
 		 178 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  43.4 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  36.08 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  36.08 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25.34 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30.99 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  25.34 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  27.66 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  29.77 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>