75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1458 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
92 aa  184  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
97 aa  97.1  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  48.35 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 
94 aa  94.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  49.45 
 
 
92 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
93 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
91 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  46.74 
 
 
92 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  44.57 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
93 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  46.74 
 
 
93 aa  90.5  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  46.74 
 
 
94 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
94 aa  87  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
93 aa  86.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  39.56 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  45.56 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
95 aa  84.3  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.76 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  40.22 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  38.04 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  40.66 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  31.52 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.67 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.99 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  24.36 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  23.08 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
83 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  21.79 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  24.36 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
78 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>