84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3337 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  75.79 
 
 		 95 aa  147  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 95 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  76.6 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  69.23 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  69.23 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  68.48 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  65.26 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  64.13 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  65.22 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  61.96 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  65.22 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  65.22 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 		 93 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  58.89 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  56.99 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  56.99 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  49.46 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  50.54 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  52.69 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  38.71 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  26.58 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  38.33 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0854  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000145562 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 141 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  28.12 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  26.25 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>