57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1946 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  91.03 
 
 		 78 aa  147  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 81 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  69.23 
 
 		 81 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  69.23 
 
 		 81 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  66.67 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  44.87 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  43.59 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  44.87 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.77 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 93 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 91 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 95 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>