106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1524 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  158  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 79 aa  137  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.58 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.62 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.86 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.92 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  37.88 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.38 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.67 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 80 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.85 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 149 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.31 
 
 		 153 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 78 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.99 
 
 		 92 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  39.34 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.43 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.07 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  30.56 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.07 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.14 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.43 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>