60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1981 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 78 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  70.51 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  85.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  85.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  47.44 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  47.44 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  62.82 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  43.59 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 93 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 93 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>