95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0061 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
90 aa  181  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  41.25 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  38.27 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.83 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  33.7 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  32.58 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.78 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  33.71 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.05 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  28.09 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  36.14 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  28.05 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  36.14 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  28.05 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  26.83 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  23.46 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  29.07 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
164 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  29.21 
 
 
93 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  26.74 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  27.85 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  25.32 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  22.95 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  32.76 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
159 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
159 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  24 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  25.3 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
83 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
160 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 
192 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
154 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  27.71 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
160 aa  40  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
151 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
170 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  25.97 
 
 
176 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  28.4 
 
 
81 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1508  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 
153 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0615903  normal  0.388273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>