83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3248 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  69.57 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  65.93 
 
 
91 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  66.3 
 
 
93 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  65.22 
 
 
95 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  64.84 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  64.13 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
93 aa  114  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
93 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
92 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  62.64 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  60.44 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 
94 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  57.61 
 
 
95 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
95 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 
93 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  53.33 
 
 
92 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 
94 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  51.11 
 
 
91 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 
93 aa  97.1  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
95 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
91 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  48.1 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  48.1 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  48.1 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
78 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  37.7 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  27.91 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  30.77 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  25.64 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.05 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
124 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
152 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
153 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
81 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  27.38 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  28.57 
 
 
157 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 
162 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 
84 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>