47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3948 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  159  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  78.21 
 
 		 78 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  78.21 
 
 		 78 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  78.21 
 
 		 78 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  71.79 
 
 		 78 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  71.79 
 
 		 78 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  71.79 
 
 		 100 aa  123  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 78 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 78 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 78 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  69.23 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 79 aa  103  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  55.13 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 81 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  52.56 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  47.44 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  56.41 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 93 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  24.36 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>