83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3788 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
78 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  97.44 
 
 
78 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 
78 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  78.21 
 
 
78 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  78.21 
 
 
78 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  75.64 
 
 
78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  74.36 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  74.36 
 
 
78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
78 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
78 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
78 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  62.82 
 
 
78 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
79 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 
86 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  52.56 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  52.56 
 
 
81 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
81 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
81 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
81 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  53.85 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
93 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
93 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.65 
 
 
92 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.77 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
95 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
162 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
155 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  20.51 
 
 
91 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 
157 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  27.42 
 
 
162 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 
158 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>