104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6098 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  75.82 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 95 aa  137  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 91 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.84 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  64.13 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  68.13 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  60.44 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  54.44 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  61.96 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  40.22 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  32.91 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.21 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  32.26 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>