66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1377 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
93 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  66.3 
 
 
94 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
91 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
94 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 
95 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  58.24 
 
 
91 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.44 
 
 
95 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  57.78 
 
 
92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  54.35 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.24 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  59.34 
 
 
95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 
92 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
92 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 
91 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
93 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  46.74 
 
 
94 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 
92 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
93 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
93 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 
93 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 
93 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
94 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  56.99 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  53.76 
 
 
93 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  49.46 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
93 aa  91.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  46.74 
 
 
92 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  46.24 
 
 
93 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  40.66 
 
 
92 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  31.87 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  33.7 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  37.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  37.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.72 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  27.91 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  30.16 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>