61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1443 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
93 aa  183  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  73.91 
 
 
93 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 
93 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  63.04 
 
 
93 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  60.87 
 
 
92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  59.34 
 
 
91 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 
93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  55.43 
 
 
93 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  54.95 
 
 
94 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 
93 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.04 
 
 
95 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  56.99 
 
 
95 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  54.35 
 
 
95 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  56.04 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  56.04 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  53.85 
 
 
95 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
92 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 
93 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  46.24 
 
 
93 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  48.89 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
92 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  38.04 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  37.36 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  47.25 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.21 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
142 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
76 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>