69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
93 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
92 aa  114  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
92 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 
93 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
94 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 
93 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
95 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  56.52 
 
 
95 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
93 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
91 aa  104  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 
93 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
91 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  59.78 
 
 
93 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  54.35 
 
 
95 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 
94 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 
92 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 
93 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  50.55 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 
93 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
91 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  50 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.65 
 
 
95 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 
93 aa  90.9  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  51.65 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 
93 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  53.76 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  35.87 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  28.05 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.18 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  30.86 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  40.82 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  40.82 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  40.82 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  40.82 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  24.36 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
142 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>