109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1507 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
94 aa  186  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  72.34 
 
 
95 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  51.11 
 
 
92 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 
92 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.17 
 
 
92 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  50 
 
 
95 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  48.89 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  48.91 
 
 
93 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  47.78 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 
95 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 
93 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  47.31 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  48.89 
 
 
94 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  47.78 
 
 
92 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
92 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  45.56 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
95 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  42.39 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  36.56 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  41.77 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  28.4 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.89 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
157 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  30.56 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  30.56 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  25.93 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  31.88 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  23.26 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  40.98 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
78 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  29.58 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  27.16 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>