85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  61.96 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  61.96 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  52.69 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  56.99 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  54.95 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  53.85 
 
 		 95 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.22 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  53.76 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 		 93 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  52.75 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  40.66 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  31.52 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  27.85 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.91 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  30 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.95 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1601  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 156 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 178 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>