58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1054 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  150  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  150  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.84 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.36 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 77 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 78 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 78 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>