108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3052 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  71.43 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  65.56 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  61.11 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 		 94 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  61.96 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  54.44 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  57.78 
 
 		 93 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  60 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  48.91 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  48.89 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  45.56 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  21.52 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  32.26 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  31.37 
 
 		 78 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 154 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 170 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 77 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 79 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  29.89 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>