119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0967 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  73.12 
 
 
94 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  73.91 
 
 
92 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  68.82 
 
 
95 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  72.83 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  70.33 
 
 
91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 
95 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  64.52 
 
 
93 aa  130  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  63.74 
 
 
91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
95 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 
93 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.34 
 
 
95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  59.34 
 
 
95 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  61.29 
 
 
93 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  55.91 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 
93 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 
92 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  54.26 
 
 
94 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.22 
 
 
92 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  53.19 
 
 
94 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
93 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  56.52 
 
 
93 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
91 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  49.45 
 
 
92 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 
93 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
92 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
97 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  48.89 
 
 
91 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  52.69 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  45.56 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
91 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 
92 aa  84.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
153 aa  52  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.16 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  42.37 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  24.05 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
151 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
152 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  22.78 
 
 
81 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>