90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2005 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
93 aa  185  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  68.82 
 
 
93 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  64.52 
 
 
93 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  65.59 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  59.78 
 
 
93 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  59.78 
 
 
93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 
94 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  61.29 
 
 
95 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
95 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  58.24 
 
 
91 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  60.22 
 
 
95 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.87 
 
 
92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  59.14 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  52.69 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 
93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  60.44 
 
 
95 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  59.14 
 
 
95 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 
93 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 
93 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 
93 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  52.69 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 
93 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  57.61 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  48.91 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  47.83 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
91 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
92 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  43.01 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  40.66 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.21 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  43.21 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.21 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
78 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  35.9 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  32.84 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.84 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.95 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  30.16 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
78 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>