81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3290 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  75.79 
 
 		 95 aa  147  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  73.4 
 
 		 94 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  62.37 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  60.64 
 
 		 94 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.95 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  63.44 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.84 
 
 		 92 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  60.44 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  62.64 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  60 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  58.24 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  54.95 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 93 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  56.04 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  44.57 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  41.76 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  23.81 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 162 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 77 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  29.49 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 78 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.54 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 78 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>