131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2704 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
92 aa  186  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  59.78 
 
 
92 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  52.75 
 
 
95 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 
94 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  50.55 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 
92 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
95 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  52.22 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  49.45 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  52.75 
 
 
93 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  48.35 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  47.25 
 
 
94 aa  90.1  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  46.74 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
93 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  48.35 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.57 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  45.56 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  44.57 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  51.65 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  40.66 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  40.66 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  29.49 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
80 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  27.16 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  38.24 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  27.03 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  33.8 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  29.07 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.26 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
332 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  24.69 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  32.1 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 
168 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>