45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3517 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  189  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  33.75 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.93 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  23.91 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  26.25 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 78 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 92 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  26.25 
 
 		 78 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.93 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>