63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3463 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  57.5 
 
 		 81 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  55 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.56 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  51.9 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  47.5 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  46.84 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  43.04 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  43.04 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3517  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  30.23 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.91 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.94 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  29.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>