101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0822 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  156  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  90 
 
 		 80 aa  148  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 80 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  88.75 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.62 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.89 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.53 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.94 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.17 
 
 		 79 aa  43.9  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  28.21 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 162 aa  43.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  35.94 
 
 		 157 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 81 aa  40.8  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  27.42 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 156 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.49 
 
 		 92 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  29.09 
 
 		 145 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  29.87 
 
 		 164 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>