78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1485 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
79 aa  156  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  85.9 
 
 
79 aa  137  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1762  AsnC family transcriptional regulator  54.88 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0710  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.32 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
80 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.28 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1001  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1408  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.141838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
80 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  27.63 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
77 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
77 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
79 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.8 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1339  hypothetical protein  31.94 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000568918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0598  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  31.51 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1275  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0634  transcriptional regulator, AsnC family  25.33 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
92 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  33.33 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
76 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  23.19 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.88 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.717659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  28.57 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
77 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
76 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>