36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0863 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2032  AsnC family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 79 aa  130  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.543407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 78 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  62.82 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  64.1 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  62.82 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  60.26 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  50 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5601  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1946  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1616  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1627  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1472  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0880758  normal  0.0357599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>