62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3207 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  63.16 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  65.33 
 
 		 77 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  63.16 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 80 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 82 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  59.21 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  58.67 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  62.67 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  54.67 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  54.67 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  38.36 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  37.84 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1277  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>