64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1935 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 77 aa  57  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.06 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.99 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.36 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  35.94 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 79 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 92 aa  40  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 76 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3607  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 78 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 97 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  31.08 
 
 		 76 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>