38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1993 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  352  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  67.95 
 
 		 78 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 76 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 77 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 76 aa  48.5  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 80 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.49 
 
 		 77 aa  48.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 79 aa  45.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  25.35 
 
 		 79 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  28.17 
 
 		 77 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 77 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 77 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 77 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 76 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 		 77 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 77 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 81 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 77 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 79 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  36.07 
 
 		 91 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 85 aa  42  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 77 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 79 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 85 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 		 77 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>