60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1911 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
75 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
75 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
75 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  74.67 
 
 
80 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  76 
 
 
80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  62.32 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  60.56 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  56.94 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 
79 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  53.62 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  52.11 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  49.3 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  52.17 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
85 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1185  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
99 aa  52  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1855  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131427  normal  0.296879 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0847  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.86037 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1993  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.556169  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  35.82 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  35.82 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1935  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.2155  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 
448 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  43.64 
 
 
448 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  40.74 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  38.18 
 
 
489 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  25.76 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 
82 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
82 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 
82 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>