24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0503 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0503  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
77 aa  154  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0598  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2808  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0149144  hitchhiker  0.005471 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0460  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
83 aa  48.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1524  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000133196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1183  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.43 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  28.77 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0668  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0995  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.370597  hitchhiker  0.00975593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1197  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>