More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4644 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4644  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  303  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.94976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  31.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  31.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  31.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  31.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  31.03 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  30.28 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0342  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0349  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  27.7 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  28.38 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  31.08 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1156  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.675806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1776  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.016302  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  32.24 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>