144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4058 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  73.91 
 
 
183 aa  256  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  61.25 
 
 
173 aa  201  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  52.47 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  46.58 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 
162 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  21.68 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  25.49 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  28.83 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  27.1 
 
 
151 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  29.13 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  29.13 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  29.13 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  27.64 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.85 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  26.54 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1753  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  32.46 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  23.78 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
171 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  22.3 
 
 
155 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  24.83 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.24 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  23.24 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  22.97 
 
 
149 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  24.3 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  21.77 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  21.77 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  22.54 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  23.94 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  21.83 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  27.1 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  29.09 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 
323 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  23.23 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  25.33 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  26 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  22.54 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  20.86 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  25.83 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  24.37 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  24.66 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  24.49 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  24 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  29.82 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  22.82 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  23.81 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.93 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  27.19 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  23.65 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  26.23 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  23.81 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  24.29 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  23.81 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.85 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  25.85 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  23.13 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  22.96 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  23.13 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  24.5 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>