More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3060 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 173 aa  344  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4058  transcriptional regulator, AsnC family  61.25 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1306  transcriptional regulator, AsnC family  51.88 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3080  transcriptional regulator, AsnC family  52.8 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1838  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1471  transcriptional regulator, AsnC family  51.03 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.24 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  24.16 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  31.82 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  33.59 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.22 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  30.36 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  28.66 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  33.03 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  28.29 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  24.83 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.28 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  23.38 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1156  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.675806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  26.21 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  26.35 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4644  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.94976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  25.32 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  24.5 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  25.35 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  27.92 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.89 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>