More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2577 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  324  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 194 aa  193  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  70.42 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 146 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 146 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 146 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 295 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.85 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  32.39 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  36.62 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.77 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  28.99 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>