15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1345 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1345  FaeA family protein  100 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00790848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0810  hypothetical protein  58.57 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.469671  hitchhiker  0.000145484 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0792  hypothetical protein  55.71 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.894596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1355  FaeA family protein  55.71 
 
 		 74 aa  97.8  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1081  putative regulatory protein  52.86 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0232  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0604  hypothetical protein  33.9 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  43.14 
 
 		 406 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0234  hypothetical protein  36.07 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.127042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0671  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 407 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1647  hypothetical protein  34.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.571239  normal  0.0164209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  37.25 
 
 		 407 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>