14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0604 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0671  CopY family transcriptional regulator  77.66 
 
 		 190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1647  hypothetical protein  70.97 
 
 		 191 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.571239  normal  0.0164209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2155  putative transcriptional regulator  72.02 
 
 		 194 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.157005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0008  regulatory protein, Crp  51.11 
 
 		 74 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1345  FaeA family protein  33.9 
 
 		 84 aa  45.1  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00790848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0653  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 		 73 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  hitchhiker  0.0036076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2364  regulatory protein, ArsR  51.11 
 
 		 72 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1081  putative regulatory protein  38.98 
 
 		 74 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2005  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 73 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1355  FaeA family protein  37.7 
 
 		 74 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.476442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  25.88 
 
 		 269 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0810  hypothetical protein  36.07 
 
 		 74 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.469671  hitchhiker  0.000145484 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0792  hypothetical protein  32.79 
 
 		 96 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.894596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>