10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0008 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0008  regulatory protein, Crp  100 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2364  regulatory protein, ArsR  66.2 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0653  regulatory protein, ArsR  67.69 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  hitchhiker  0.0036076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2005  ArsR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0604  hypothetical protein  51.11 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2155  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.157005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1647  hypothetical protein  41.86 
 
 		 191 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.571239  normal  0.0164209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0671  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  50 
 
 		 387 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  46.34 
 
 		 395 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>