More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2641 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  234  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  99.12 
 
 		 118 aa  233  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30.59 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 226 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  34.12 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  42.25 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  36.99 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  28.92 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  29.47 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  37.18 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  43.48 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40.26 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  33 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  34.65 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  28.92 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  34.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  33.75 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>