39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2731 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 
228 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  37.89 
 
 
238 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  40.09 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 
233 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  40 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 
234 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 
234 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 
234 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 
241 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  36.06 
 
 
209 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  26.42 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  26.34 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  25.48 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.48 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  26.76 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  23.39 
 
 
261 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  27.19 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  30.64 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  30.64 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  28.21 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  30.64 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  26.91 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  27.91 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>