57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3352 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  51.56 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  51.8 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  46.49 
 
 		 242 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  51.12 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  42.13 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 261 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  34.81 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  20.95 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  21.43 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  20.95 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  29.86 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  23.35 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>