42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0236 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  89.81 
 
 		 218 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  39.32 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  30.95 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  28.18 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.19 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  21.39 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  20.21 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  21.56 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.35 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  21.56 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  20.93 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  20.93 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  21.56 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  20.86 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  21.56 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  20.93 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>