55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3651 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  40.27 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 225 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  42.23 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  33.98 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  29.66 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  32.52 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  38.07 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  31.35 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  27.4 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  19 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  26.09 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  19.9 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  19.9 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  19.9 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  19.9 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  20 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  31.34 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>