88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2372 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  67.84 
 
 		 232 aa  328  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  59.31 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  58.12 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  58.01 
 
 		 231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  57.58 
 
 		 231 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  57.14 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  57.14 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.29 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.37 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  21.63 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  22.75 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  22.05 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  23.44 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  24.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  24.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  24.08 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  22.77 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  22.83 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  21.84 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  22.7 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  19.46 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  22.07 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  20.79 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  23.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  26.34 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  21 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  23.3 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  22.27 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  21.84 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  20.85 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  23.19 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  31.11 
 
 		 388 aa  42  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  19.67 
 
 		 242 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  23.79 
 
 		 206 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  22.75 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>