71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0307 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  33.51 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  30.35 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  28.29 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  31.79 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  26.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  38.24 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  24.24 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  25.49 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  26.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2819  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  28.82 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2296  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000358822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  24.88 
 
 		 275 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  32.1 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  37.68 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>