49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0152 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  43.86 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  42.98 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 225 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  31.14 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.4 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  33.19 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.38 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  22.64 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  22.49 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  22.97 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  22.49 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  22.97 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  21.53 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  22.49 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  22.49 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  22.01 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  22.6 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  23.47 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 233 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>